Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5CP41229 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms