Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms