Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDRP35968 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDRP35968 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDRP35968 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KDRP35968 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KDRP35968 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDRP35968 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KDRP35968 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms