Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GTF2E1P29083 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms