Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GCAP28676 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GCAP28676 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GCAP28676 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms