Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5A1P25705 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms