Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG2P13727 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms