Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLBP1P12271 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLBP1P12271 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms