Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms