Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM225BP0DP42 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM225BP0DP42 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms