Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms