Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HLA-DQB1P01920 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLA-DQB1P01920 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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