Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms