Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN7O94888 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms