Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F6O75461 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F6O75461 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms