Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms