Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN2O60636 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms