Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms