Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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