Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms