Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6BA6NDN3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GOLGA6BA6NDN3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms