Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GY05 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GY05 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GY05 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
V9GY05 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GY05 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GY05 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GY05 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
V9GY05 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
V9GY05 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
V9GY05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GY05 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GY05 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GY05 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
V9GY05 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GY05 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GY05 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GY05 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GY05 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GY05 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GY05 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
V9GY05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GY05 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GY05 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GY05 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GY05 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GY05 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GY05 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
V9GY05 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
V9GY05 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
V9GY05 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
V9GY05 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
V9GY05 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
V9GY05 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
V9GY05 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
V9GY05 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
V9GY05 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
V9GY05 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
V9GY05 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
V9GY05 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
V9GY05 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
V9GY05 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
V9GY05 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
V9GY05 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
V9GY05 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
V9GY05 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
V9GY05 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
V9GY05 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
V9GY05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
V9GY05 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
V9GY05 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
V9GY05 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
V9GY05 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
V9GY05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
V9GY05 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
V9GY05 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
V9GY05 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
V9GY05 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
V9GY05 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
V9GY05 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
V9GY05 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
V9GY05 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
V9GY05 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms