Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN6Q9Y6Q1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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