Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PARP3Q9Y6F1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PARP3Q9Y6F1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PARP3Q9Y6F1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP3Q9Y6F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP3Q9Y6F1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.8 ms