Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPQQ9Y646 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPQQ9Y646 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPQQ9Y646 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms