Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NUBP2Q9Y5Y2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUBP2Q9Y5Y2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUBP2Q9Y5Y2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms