Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P6

GMPPB, Mannose-1-phosphate guanyltransferase beta, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMPPBQ9Y5P6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMPPBQ9Y5P6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GMPPBQ9Y5P6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMPPBQ9Y5P6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms