Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHAC2Q9Y5I4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHAC2Q9Y5I4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms