Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCTD3Q9Y597 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCTD3Q9Y597 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCTD3Q9Y597 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCTD3Q9Y597 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms