Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL3Q9Y4R7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL3Q9Y4R7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms