Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HECTD4Q9Y4D8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HECTD4Q9Y4D8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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