Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRELID3BQ9Y3B1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRELID3BQ9Y3B1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms