Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFR3BQ9Y2G0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFR3BQ9Y2G0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms