Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9A8Q9Y2E8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A8Q9Y2E8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A8Q9Y2E8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A8Q9Y2E8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms