Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC4Q9Y296 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC4Q9Y296 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms