Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRRM2Q9UQ35 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM2Q9UQ35 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms