Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH4Q9UQ05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNH4Q9UQ05 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNH4Q9UQ05 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms