Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRAK1Q9UPV9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRAK1Q9UPV9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAK1Q9UPV9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAK1Q9UPV9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms