Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPA1Q9UND3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPA1Q9UND3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms