Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX12Q9UMY4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX12Q9UMY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX12Q9UMY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms