Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BARX2Q9UMQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BARX2Q9UMQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BARX2Q9UMQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms