Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP2Q9ULQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP2Q9ULQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP2Q9ULQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP2Q9ULQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP2Q9ULQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STRIP2Q9ULQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
STRIP2Q9ULQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STRIP2Q9ULQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRIP2Q9ULQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms