Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCOLCE2Q9UKZ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCOLCE2Q9UKZ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCOLCE2Q9UKZ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCE2Q9UKZ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms