Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HDAC9Q9UKV0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HDAC9Q9UKV0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HDAC9Q9UKV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC9Q9UKV0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms