Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSR3Q9UJK0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR3Q9UJK0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR3Q9UJK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms