Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAX2Q9UIW0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX2Q9UIW0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX2Q9UIW0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms