Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT7Q9UIV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNOT7Q9UIV1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT7Q9UIV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNOT7Q9UIV1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms