Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT1Q9UHJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFMBT1Q9UHJ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFMBT1Q9UHJ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms