Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX20Q9UHI6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX20Q9UHI6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX20Q9UHI6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX20Q9UHI6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms