Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA9Q9UGM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA9Q9UGM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms